USPEX v9.2.7新版发布!
新年伊始,世界知名的晶体结构预测软件USPEX 发布最新9.2.7版,更新内容有
1.合金序优化:即最小化或最大化序或准熵(不进行结构弛豫)。这使得在新版USPEX中能够轻松实现比“特殊准随机结构模型更一般的准随机结构,由于不进行结构弛豫(需引入参数abinitioCode=0),因此即便对于较大的超晶胞,计算速度也非常快。
2.确定空间群:用户可以手动在 INPUT.txt中输入误差参数 SGtolerance(支持字符或数值,low/medium/high=0.01/0.04/0.10)。第一原理计算中,推荐使用medium或low对称性。过度对称化将产生声子软模,须进行检查。
3.更好地处理对称性:显著地改进了对固定晶胞计算的情况。
4.固定晶胞计算:用户可以指定晶胞参数,既可以使用3X3矩阵的表示形式,也可以使用晶矢长度和晶矢夹角的表示形式,如(10.010 8.756 4.789 90.0 90.0 90.0)。
5.参数修正:对交换排列的数目howManySwaps参数设置了智能的默认值,对几乎所有情况,都无需再手动修改该参数。
6.算法改进:使用“Antiseed”技术改进了进化算法的分布多样性,增强了搜索全局最小值的能力。
7.团簇结构:通过引入椭球率和”order-enhanced heredity”算法,显著改进了对团簇结构的计算。USPEX性能超过了其他基于标准LJ势的团簇结构预测代码性能。
8.新增接口:增加了CASTEP程序的接口。
9.增加算例:
●产生准随机结构(T18)
●“Antiseed”技术(T3,替换原有T3)
●与Quantum Espresso结合计算算例(T19)
●即将推出与CASTEP和ATK结合计算算例
10.可视化:USPEX结构可直接使用VESTA程序可视化 (http://jp-minerals.org/vesta/en/)。
USPEX小组将在2013年举办两期培训班
●墨西哥普埃布拉(Puebla)8月28日-9月6日;
●中国桂林(时间待定)。
●Chen Y, Hu Q-M, Yang R. (2012) Predicted suppression of the superconducting transition of new high-pressure yttrium phases with increasing pressure from first-principles calculations. Phys. Rev. Lett., 109, 157004.
●Zhou XF, Oganov AR, Qian GR and Zhu Q (2012) First-principles determination of the structure of magnesium borohydride. Phys. Rev. Lett., 109, 245503.
●Zhu Q, Jung DY, Oganov AR, Glass CW, Gatti C and Lyakhov AO (2013) Stability of xenon oxides at high pressures. Nature Chemistry 5, 61-65.
●Zhang W, Oganov AR, Goncharov AF, Zhu Q, Boufelfel SE, Lyahkov AO, Somayazulu M and Prakapenka VB (2012) Unexpected stable stoichiometries of sodium chlorides. Submitted. See http://arxiv.org/abs/1211.3644
●Zhu Q, Oganov AR, Lyahkov AO (2012) Unexpected stoichiometries in Mg-O system under high pressure. Submitted. See http://arxiv.org/abs/1211.6521.