Khimera帮助工作在燃烧、等离子体化学和材料科学等领域的科研工作者应用量子电子学和量子化学软件来进行原子模拟的工具。Khimera是研究和分析化学过程的软件包,它简便反应机理发展,从基本的分子数据中估测热力学、传送和动力学参数,进行反应器水平的模拟。
主要特点:
动力学机理建模包括敏感度分析和自动的机制缩减能力;
使用多种现代理论方法来计算基本的单分子和双分子反应的速率常数;
直接从著名的量子化学代码Gaussian, ADF, Jaguar,GAMESS 的输出文件中导入数据;
含有大量物质、反应和化学机理的动力学和热力学参数的数据库;
一系列的反应器模块可以模拟所有的反应过程,并且可以证明/分析反应机理。
Khimera包含一个准-3D分子察看器,以图形方式显示计算结果。Khimera有文件导入/导出的能力,可以方便的应用在各种反应机理研究和动力学分析中。现在还有超文本的帮助功能。
功能:
基本反应的热动力学和运动学
Khimera可识别量子化学计算的结果(目前支持Gaussian, GAMESS和Jaguar程序),这些计算结果都是关于基本的气-气和气-液反应,而这些反应都包含所研究化学过程的(假设)机理。这些结果(能量,频率,以及反应物,过渡态和最终产品的结构)被用来计算焓值,熵值和单个反应的速率。
1. 过渡态理论和直接生物分子反应;
2. 带有或不带有强碰撞假设的单分子RRKM模型;
3. 经历长寿命中间体络合物的分子气相反应模型;
4. 基于普遍过渡态理论和统计理论,并考虑到表面扩散的微观表面动力学模型;
5. 同时依据Langevin方法和统计理论的离子-分子反应模型;
6. 反应速率参数和热动力性质的计算结果将被输出为CHEMKIN输入格式,以便进一步利用动力学软件包进行分析。
反应器模型
1. 对化学机理进行敏感分析的反应器模型(Calorimetric Bomb Reactor, Plug-Flow Reactor和Well Stirred Reactor),应用于气相化学和表面化学;
2. 基于活性点的异相化学模拟反应器模型(Calorimetric Bomb Reactor, ALD Reactor, Well Stirred Reactor和Plug-Flow Reactor);
3. 基于Monte Carlo方法的异相化学模拟反应器;
4. 理想异相热动力平衡的反应器模型
|