分子脂水分配系数是决定分子在生物体内吸收与分布的重要因素之一。分子摩尔折射率可以用于表达分子的极性。ClogP/CMR采用分子片断作为探针来预测分子的脂水分配系数，采用原子探针来计算分子的摩尔折射率，计算结果能够自动填充到分子表单，作为QSAR中的分析参数。