北京宏剑公司-TPSA
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TPSA
用于预测化合物的拓扑极性表面积
   
概念     分子极性表面积(PSA)是一个描述与分子被动传输通过膜相关的概念,它可以预测人体肠吸收、Caco-2单层渗透性和血-脑屏障渗透。为了简化极性表面的计算,Ertl等提出了拓扑极性表面积(TPSA)的概念。它的基本假设是分子中每种相同原子或基团类型对极性表面积的贡献都是相似的,整个分子的TPSA就是所有原子或基团贡献的加和。

原理     Pallas软件中的TPSA是基于规则的专家系统,计算的参数是基于已有极性片段数据库的。这些片段的贡献是通过对来自于世界药品库34810个药物单个构象3D PAS的最小二乘法拟合来确定的。实际上TPSA提供的结果和经典的3D PSA的结果是一致的,而计算的速度较经典的快2到3个数量级。
方案     在合成化合物之前,可以高通量预测TPSA值;
预测脑血分配系数,例如采用Kelder方程:lgBB=1.33-0.032PSA;Clark方
程:lgBB=0.55-0.016PSA
预测肠通透性,例如:对Stenberg等人发表的14个化合物来说,PSA <60?时,分子能够被完全吸收;PSA >140? 时,分子的通透性很差;PSA 在60~140? 之间时,分子的通透性随极性表面积的增加而逐渐减小。
操作平台:Windows/Linux/Web
详细信息请登陆产品供应商网站:美国CompuDrug公司www.compudrug.com