FlexX

如今，PDB数据库中逐渐增多的生物大分子结晶为以分子对接为手段评价配体与受体的相互作用的直接药物设计提供了丰富的资源。FlexX以片断构建的方法来进行对接，充分考虑配体柔性，能够快速进行受体和配体的对接。FlexX集成了基于结构的药物设计理念，首先将配体的核心结构放置在合适的位置，然后在结合腔内进行结构的重新构建，充分考虑受体-配体相互作用。由于配体分子的最低能量构象往往不是产生生物效应的构象，因此FlexX充分考虑配体的柔性的特点，能够显著地提高对接的质量。FlexX快速进行对接的特点令用户完全可以在组合化学合成之前将虚拟的化学库进行对接和评价。