AMPAC+CODESSA

AMPAC

Semichem 公司的半经验量子力学程序,计算速度快。它包含图形用户界面AGUI,具有和GaussView相似的界面和功能(GaussView 就是该公司Gaussian 公司合作开发的产品),可以构造分子和图形显示全部计算结果。支持AMPAC 和Gaussian 的计算任务。

 

AMPAC 图形界面管理分子轨道能级  AMPAC 显示过渡态的铜金属表面
AmpacCodessa1 AmpacCodessa2

AMPAC 主要功能
1. 计算模块:

  1. 半经验方法有:SAM1,AM1,MNDO,PM3,MNDO/C,MINDO/3,MNDO/d
  2. 从头计算方法RHF 和UHF
  3. 模拟退火,用于自动定位多个最小值
  4. 高级的过渡态定位方法(CHAIN, IRC, EF, TRUST)
  5. 开壳体系的组态相互作用(CI),完全解析形式,更加稳定
  6. 预测特性:热动力学,ESR,振动光谱,电子影响,NLO
  7. 用COSMO 处理溶剂体系
  8. 激发态
  9. 对指定的态进行几何优化
  10. 反应路径计算
  11. 内反应坐标计算
  12. 力常数和振动频率分析
  13. 简正模式分析
  14. 溶剂分子特性
  15. 热动力学特性
  16. 局域化轨道
  17. 共价键序和电荷分布(Mulliken,ESP,NBO,Coulson)
  18. 可选的AMSOL 模块(需另外购买),对溶剂体系进行其它处理。

 

2. 图形用户界面:

  1. 使用与 GaussView 相似的图形用户界面,可以设置AMPAC 和Gaussian 的计算。
  2. 易用的 3D 建模、显示和操作工具
  3. 完全兼容 Gaussian 03
  4. 显示Gaussian 03 和AMPAC 的曲面/分子轨道
  5. 多种预定义最小化的化学结构模块(环,基团,氨基酸,配合基)
  6. 显示预测的振动光谱和活性振动模式
  7. 可以多次 UnDo/ReDo 用于编辑结构
  8. 通过完全交互的对话框设置计算
  9. 在 GUI 中提交和管理任务
  10. 新的代码改善了 OpenGL 中的功能
  11. 输出图形文件用于打印和网络出版
  12. 特有的 Z-矩阵编辑器,可以完全控制结构

 

AMPAC 9.0 的新功能
1. J.J.P. Stewart 的新半经验方法PM6。PM6 已对大多数主族元素和许多过渡元素实现了参数化。
2. 新半经验方法RM1。通过仔细挑选数据集和新的优化算法,RM1 在AM1 的理论框架下重新进行参数化。
3. 正式加入溶剂化模型AMSOL。
4. 改善了组态相互作用(CI)功能:CI 解析梯度,CI 支持COSMO 和AMSOL 溶剂化模型,可以处理溶剂中的开壳层体系和激发态。
5. 增强了对大分子的支持。
6. 更快更稳定。

 


 

CODESSA

CODESSA 是佛罗里达大学开发的计算化学多元定量结构活性性质的统计分析和预测程序。它是一个高级的,具有全面描述符的定量构效关系(QSAR)和定量构性关系(QSPR)程序,该程序将AMPAC 和其它QM 程序与实验数据关联在一起。这些程序一起,使得研究者能回答一些重要的问题。无论在学术领域还是在商业领域,一些已经发表的文章显示了。

 

CODESSA 描述符选择对话框 CODESSA 实验数据和计算数据的比对图
AmpacCodessa3 AmpacCodessa4

 

CODESSA 主要功能

  1. 计算几何、拓扑、量子化学和电子参数等数百种描述符
  2. 计算电子分子轨道和有机分子中的能级
  3. 计算预测如气相色谱的保留顺序
  4. 计算聚合物的玻璃化温度
  5. 计算临界胶束浓度,毒性,沸/熔点,以及闪点等性质