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LocalSCF程序是在超大蛋白质体系的量子力学模拟方面的一次突破。首次使大型的(原子数在100,000以上)、复杂的真实蛋白质体系能够在PC机上实现量子化学计算,在量子力学的理论级别进行蛋白质模拟,需求的硬件资源少,计算相当快。可以免费试用一个月。
功能
1. 在普通的PC平台上运行。
2. 可以计算超大的、十万以上原子的体系。
3. 特别适合于蛋白质体系的快速的高级几何优化方法:
从笛卡儿坐标识别蛋白质结构;高度组织化的结构性质的检查与验证;识别各种分子片段(氨基酸骨架,侧链,终端原子,水分子和平衡离子);定义特殊的分子片段或氨基酸序号后,通过直观和易用的界面指定几何优化模式;基于关键字识别和快速优化酶结合腔内的药物分子。
4. 线性标度的COSMO溶剂化模型:
类似于执行屏蔽模式的连续导体;相对于气相计算而言,增加的内存只需要两倍左右;COSMO模型的几何优化。
5. 快速多极方法:
内存需要很少,特别是对大体系和高精度求解库仑相互作用的计算;对系统资源占用提供灵活的控制。
6. 真正的变分线性标度方法:
对短程局域化分子轨道保留高精度(LMO越短程,需要的RAM越少);用户可以自己控制速度与精度之间的最佳平衡;内置的精度确认机制,允许与特定关键字选项有关的分子特性的比较。
7. 其它功能:
半经验哈密顿量有MNDO,AM1,PM3,PM5;到CAChe和BioAdviser的图形用户界面。