Gold

GOLD 一个计算大分子与小分子结合模式的分子对接程序

GOLD是一个计算大分子与小分子结合模式的分子对接程序,是Sheffield大学,laxoSmithKline公司和CCDC协作的产物。因其准确性和可靠性在分 子模拟圈内评价很高。GOLD的遗传算法最适合虚拟筛选和并行计算。目前发布的版本可在商业的PC GRID系统上使用。它采用遗传算法(GA)进行蛋 白-配体对接;对接时配体完全柔性和蛋白部分柔性;能量函数部分依赖于来自CSD数据库的构象和非键接触;打分函数有GoldScore、ChemScore和用 户自己定义的打分函数;多种限制选项;对接结果后处理工具:SILVER;自动考虑活性口袋内结合的水分子;改进的处理金属配位结构方法;对特 别的配体自动衍生GA设置。